故事从元治元年（1864年）3月的京都开始。 双亲被长州藩士所杀，一心想要变强、报仇的15岁少年市村铁之助敲响了新选组的大门——他想要加入新选组。而他的哥哥辰之助刚刚被作为会计录用。可是因为矮小的身材和恶劣的态度，铁之助受到了冷遇。这时，他遇到了一位自称在新选组中“有熟人 ...